在中国，婚姻法规定，夫妻分居满两年的，有一方可以向人民法院提出离婚诉讼。因此，夫妻分居三年后可以自动离婚的说法并不准确。
在实际操作中，若夫妻都愿意离婚，可以签署离婚协议书并在民政局办理离婚手续，此时便可以达成自愿离婚。但如果一方不愿意离婚，另一方则需要向法院提起诉讼进行判决，才能实现离婚。在此过程中，如果对方抵制，也可能导致离婚拖延。
此外，分居后的夫妻之间可能存在很多财产问题，如共同财产分割、子女抚养费问题等等，需要在离婚协议或者离婚诉讼中进行协商。若协商不成功，则需要通过法院判决来解决这些问题。
总之，夫妻分居并不意味着自动离婚，离婚需要依据法律规定，且可能遇到一些法律和财产纷争问题。因此，建议在决定离婚前，应该慎重考虑，理智处理各种事项。