在离婚案件中，如果女方患有乙肝病毒，那么孩子归谁的问题就需要通过法律的程序来解决。需要明确的是，患有病毒的女方并不会因此失去拥有抚养孩子的权利。法律规定，无论是母亲还是父亲，只要具备合法的抚养条件和能力，就有权利拥有孩子的抚养权。
但是需要注意的是，由于乙肝是一种传染性疾病，附着在血液和其他体液上，因此在处理抚养问题时，需要考虑到疾病传播的可能性。如果女方的病毒满载量很高，存在传播危险，那么可能会影响孩子的健康，因此需要采取相应的防护措施。
在具体操作中，可以将孩子的监护权授予相对健康的一方，比如父亲或其他家庭成员，以减少孩子被感染的风险。此外，也可以采取隔离措施或者使用防护措施，比如外出戴口罩，勤洗手等，以确保孩子的健康与安全。
在离婚案件中，女方患有乙肝病毒并不会直接导致孩子的归属问题。但是需要考虑到疾病传播的可能性，采取相应的防护措施，以确保孩子的健康与安全。