如果一对夫妻没有结婚证但已有孩子，他们需要离婚时，需要按照法律程序操作。以下是常见的步骤：
1. 先确认夫妻是否需要办理法定离婚。如果是夫妻双方均同意离婚，没有争议，也没有财产、房产、子女抚养等问题需要解决，双方可以直接协议离婚。在此情况下，夫妻不需要向人民法院申请离婚，只需去当地的民政部门申请注销户口即可。
2. 如果夫妻之间有分歧，如财产分割、抚养子女等争议，就需要办理司法离婚。先去当地的人民调解委员会调解，如果调解不成，就需要向人民法院提起离婚诉讼。
3. 对于没有结婚证的夫妻，需要提供证明夫妻关系的证据。比如，结婚当天的照片、亲友的证人证言、共同生活证明等。
4. 对于孩子的抚养问题，夫妻可以通过协议或者法院判决解决。如果父母均有能力抚养孩子，则孩子可以由双方轮流抚养。如果一个人无法承担抚养责任，则需要由另一个人独立抚养。抚养费的具体数额需要根据当地的法律规定来确定。
没有结婚证的夫妻需要按照法定程序进行离婚，如果存在争议问题，需要到人民法院解决。同时，孩子的抚养问题也需要在离婚协议或者法院判决中得到解决。